Il Consiglio Direttivo di Transcrime è formato da otto membri provenienti dalle Università che lo compongono ed è l'organo di indirizzo del Centro.

Il Consiglio si riunisce periodicamente con il compito di provvedere alla predisposizione ed approvazione del piano annuale delle attività, del bilancio preventivo e consuntivo, nonché  di eventuali regolamenti interni. Il Consiglio inoltre nomina il Direttore ed il Vice Direttore del Centro, istituisce e nomina le eventuali commissioni o comitati scientifici.

Il Consiglio Direttivo del Centro è attualmente composto da (in ordine alfabetico):

  Prof. Vincenzo Cesareo 
Membro designato dall'Università Cattolica del Sacro Cuore

  Prof. Michele Colasanto 
Membro designato dall'Università Cattolica del Sacro Cuore

  Prof. Vincenzo Della Sala 
Membro designato dall'Università degli Studi di Trento

  Prof. Ugo Draetta 
Membro designato dall'Università Cattolica del Sacro Cuore

  Prof. Gianfranco Ferrari 
Membro designato dall'Università degli Studi di Trento

  Prof. Gabriele Fornasari 
Vice Direttore e membro designato dall'Università degli Studi di Trento

  Prof. Lorenzo Sacconi 
Membro designato dall'Università degli Studi di Trento

  Prof. Ernesto Savona 
Direttore e membro designato dall'Università Cattolica del Sacro Cuore